Instalación de Conda en Google Colab

Índice

🔍 Introducción
🔧 Instalación de Conda en Google Colab
📦 Instalación de paquetes adicionales
🧪 Instalación del paquete RTkits
🧬 Instalación del paquete Article
🔬 Uso del paquete Article en química informática
📊 Instalación del paquete EqMax
🌊 Simulación de dinámica molecular con EqMax
📚 Conclusiones y recomendaciones
❓ Preguntas frecuentes

Instalación de Conda en Google Colab

Bienvenidos nuevamente al canal de YouTube del Profesor de Datos. Si eres nuevo aquí, mi nombre es Janine Nantes y soy profesora asociada de bioinformática en este canal de YouTube, cubrimos conceptos de ciencia de datos y tutoriales prácticos. Entonces, si te interesa este tipo de contenido, por favor considera suscribirte.

Probablemente estés haciendo un buen uso de Google Colab para tus proyectos de ciencia de datos y digamos que hay algunos paquetes particulares que te gustaría instalar y usar en tu Google Colab, pero no es posible cuando escribes Conda. En este video te mostraré exactamente cómo podemos instalar Conda directamente en Google Colab y luego te mostraré cómo instalar otros paquetes usando Conda.

El primer paso es dirigirse al repositorio de GitHub del Profesor de Datos, hacer clic en el repositorio de código y luego hacer clic en el repositorio de Python. Encuentra "Google Colab instala Conda" y haz clic en eso. Luego, puedes hacer clic con el botón derecho en el enlace "raw", "guardar enlace como" y guardarlo en tu computadora. Alternativamente, también puedes abrir tu Google Colab y encontrarlo allí. Permíteme mostrarte.

Haz clic en la pestaña de GitHub, busca "data professor" e ingresa. Luego, busca "Google Colab instala Conda". Ok, así que puedes ver que el código de hoy será bastante corto, solo serán dos celdas y esencialmente podrías usar la primera celda y mantenerla a mano en la parte superior de tu cuaderno. Instalará Conda antes de que realmente comiences tu flujo de trabajo. Lo bueno de esto es que Conda gestiona la instalación de paquetes y la dependencia del paquete.

En bioinformática, por ejemplo, hay un paquete llamado RT kits. Típicamente, ese paquete implicará un proceso de instalación bastante largo donde tendrás que compilar en C y hacer varias instalaciones y asegurarte de que todas las dependencias estén instaladas correctamente. Pero cuando lo instalas en Conda, es solo una línea de código. Es muy útil y conveniente. Puedes mantenerlo en la parte superior de tu cuaderno antes de ejecutar las otras celdas como parte de tu flujo de trabajo.

(Continuará...)