一个智能路由技能,可将生物信息学数据可视化请求分发给高度可定制、满足出版要求的子技能,包括火山图、热图、小提琴图和散点图。
从源直接安装技能的最快方式。
npx clawhub@latest install bioinformatics-plot-generator
将技能文件夹复制到以下位置之一
~/.openclaw/skills/ <project>/skills/ 优先级:工作区 > 本地 > 内置
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请帮我使用 Clawhub 安装 bioinformatics-plot-generator。如果尚未安装 Clawhub,请先安装(npm i -g clawhub)。
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生物信息学绘图生成器是一个专为 AI Agent 和开发者工作流程设计的路由接口,作为可视化复杂生物数据集的中心枢纽。它利用 Openclaw Skills 智能解析用户的绘图请求(范围涵盖差异表达分析、基因组筛选到相关性分析),并自动将任务分发给相应的可视化子技能。每个脚本均可高度定制,生成标准双格式(300 DPI PNG 和矢量 SVG)输出,非常适合同行评审的学术出版物。
通过在统一的路由机制下整合多种专用绘图库,开发者和 AI Agent 无需手动调整参数或从零开始编写脚本,即可无缝生成复杂的视觉效果。无论您需要聚类基因表达热图、统计比较雨云图还是带注释的火山图,此技能都能简化科学可视化流程。
plot-volcano、plot-heatmap、plot-box-violin 或 plot-scatter-bar)。在使用这些 Openclaw Skills 之前,请确保您的环境中已安装目标包。这些脚本依赖于标准的科学 Python 库,如 numpy、pandas、matplotlib、seaborn、adjustText 和 scipy。
运行火山图生成:
python plot-volcano/scripts/plot_volcano.py \\
--input results.tsv \\
--feature-col gene \\
--x-col log2FoldChange \\
--p-col padj \\
--output volcano.png
生成表达热图:
python plot-heatmap/scripts/plot_heatmap.py \\
--input expression_matrix.tsv \\
--index-col gene \\
--output heatmap.png
创建带统计检验的分布小提琴图:
python plot-box-violin/scripts/plot_box_violin.py \\
--input data.tsv \\
--value-col expression \\
--group-col condition \\
--plot-type violin \\
--output violin.png
生物信息学绘图生成器需要表格数据(TSV、CSV 或数值矩阵)并组织输出视觉资产。子技能的通用属性定义如下:
| 子技能 | 输入格式 | 必需列 / 维度 |
|---|---|---|
plot-volcano |
表格 (TSV/CSV) | 特征 ID、Log Fold-Change、p-value 或调整后的 p-value |
plot-heatmap |
数值矩阵 | 行索引(基因/蛋白质)和列标题(样本) |
plot-box-violin |
表格 (TSV/CSV) | 数值,离散分组/条件列 |
plot-scatter-bar |
表格 (TSV/CSV) | 数值坐标、大小缩放或类别标记 |
--output-svg),用于在 Adobe Illustrator 或 Inkscape 中进行无限缩放。加载中
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